Програма працює через веб-інтерфейс (не у браузері, а в спеціальному програмному терміналі, схожому на використовуване в Google Deskbar) і індексує текстові і HTML-файли, документи форматів Microsoft Office і PDF, музику у форматі MP3, браузерний кеш і поштові бази Outlook і Outlook Express. Пошук в базах поштових клієнтів Mozilla Thunderbird і The Bat повинен з'явитися в наступних версіях програми, як і можливість підключення плагінов для індексації файлів інших типів.
Як і в інтернет-пошуку "Яндекса" результати можна відсортувати по популярності або даті, а також вести пошук у вже знайденому для уточнення результатів. Важливою перевагою "Персонального пошуку" "Яндекса" є облік російської морфології, якої в зарубіжних персональних пошукачах, із зрозумілих причин, немає.